Июль 1941 года. Фашисты рвутся к Киеву. Обстановка в городе накаляется с каждым днем, что добавляет работы лучшему следователю киевской военной прокуратуры Ивану Рокотову. Из Москвы прибывает заместитель главного военного прокурора РККА Николай Мирский. Он создает особый отдел в военной прокуратуре фронта, в который входят Рокотов и бывший следователь Днепропетровского УГРО Светлана Елагина. Рокотов и Елагина приступают к расследованиям особо важных дел, действуя как на передовой, в Киевском укрепрайоне, так и в самом городе, где активизировавшийся преступный мир начинает объединяться с немецкими диверсантами. Параллельно Мирский ведет собственное расследование, задача которого – выявить шпионскую организацию, действующую в Киеве еще с конца 30-х годов.

1943 год. Молодой физик-ядерщик Чарли Айзекс переезжает вместе с женой и сыном в закрытый городок Лос-Аламос, штат Нью-Мексико, для работы над секретным проектом по созданию атомной бомбы, получившим название Манхэттенский. Он попадает в команду харизматичного лидера Рида Экли, разрабатывающую пушечную модель бомбы. Однако в Лос-Аламосе существует и другая конструкторская группа, занимающаяся так называемой моделью имплозии. Лидер этой группы из пяти человек — Фрэнк Уинтер, соперник Экли. Противоборство конструкторских групп, шпионаж, секреты, особый режим — всё это ожидает жителей Лос-Аламоса.